В МОУ Баевская СШ действует первичная профсоюзная организация, задача которой заключается в том, чтобы защищать права и интересы работников, контролировать справедливость оплаты труда и соблюдение работодателем трудового законодательства. Членство в профсоюзе является добровольным.
Члены профсоюза имеют право на приобретение путёвок в санатории со скидками в 20 и 30%, а так же на выплаты в связи с юбилеями и скорбными обстоятельствами, возможны возвраты определённых сумм за оплату дорогостоящего лечения, как членов профсоюза, так и их детей.